1991
23 de março – Morre José Maria Antunes, vencedor da primeira edição da Taça de Portugal, em 1938/39, ao serviço da Associação Académica de Coimbra (onde jogou sete épocas). Foi o primeiro “capitão” a receber a Taça de Portugal. Nasceu em Ceira (Coimbra), a 27 de julho de 1913. Celebrizou-se pelo seu famoso lenço branco atado à cabeça. Licenciou-se em medicina.
28 de junho – A Assembleia Geral da AFC (Acta nº 97) reconhece mais dois Sócios de Mérito: 259. António Pereira Júnior (dirigente CF União de Coimbra); 260. António Raúl Dinis Costa (dirigente AD Lagares Baixo).
29 de novembro – A Assembleia Geral da AFC (Acta nº 98) reconhece mais dois Sócios de Mérito: 261. Jorge Alfredo da Costa Lopes (jogador); 262. José Manuel Serralheiro Batista (jogador).
1992
No conjunto da I (159), II (109), II B (194) e III (242 jogos) Divisões Nacionais, atuaram 702 jogadores com passaporte estrangeiro. Os brasileiros eram os mais representados (251), seguidos de guineenses (96), angolanos (65), cabo-verdianos (42), venezuelanos (31), jugoslavos (27) e búlgaros (26).
9 de setembro – Finalíssima da Supertaça Cândido de Oliveira no Estádio Municipal de Coimbra, com o FC Porto a bater nos penáltis o Boavista FC.
1993
19 de novembro – A Assembleia Geral da AFC (Acta nº 100) reconhece mais um Sócio de Mérito: 263. Fernando da Cruz Ramos (dirigente do Febres SC).
1994
Em atualização.
1995
24 de novembro – A Assembleia Geral da AFC (Acta nº 104) reconhece mais 5 Sócios de Mérito: 264. Dr. Manuel B. Branco (dirigente ADC da Rega); 265. David Ferreira de Gouveia (jogador); 266. Mário José Santos Cristo (jogador); 267. Joaquim Martins das Neves (massagista do F. de Vilela); 268. António Azevedo Rodrigues (dirigente do Tabuense).
15 de dezembro – O Tribunal de Justiça da União Europeia considera ilegais as limitações impostas às transferências de jogadores entre clubes de Estados-membros, considerando que tal contrariava o princípio da livre circulação de trabalhadores no espaço comunitário. Conhecido pelo “Acórdão Bosman” ou “Lei Bosman”, devido ao nome do jogador que levou a cabo o processo, alterou profundamente o panorama do futebol europeu.
1996
23 de maio – A Liga Profissional de Clubes de Futebol decide aplicar a Portugal a “Lei Bosman”.
25 de junho – Publicação em Diário da República da Lei de Bases do Sistema Desportivo, que introduziu três alterações importantes no futebol português: a consagração da Liga Profissional de Clubes e a eliminação do Organismo Autónomo; a possibilidade de criação de sociedades anónimas desportivas (SAD) nos clubes com atividade futebolística profissional: e a criação de associações promotoras do desporto, com finalidades lúdico-desportivas.
27 de junho – Votação na Assembleia da República do denominado “Totonegócio”, que pretendia alterar o regime jurídico de distribuição das receitas do Totobola. As três propostas de lei foram rejeitadas.
1997
A Associação Académica de Coimbra ficou em terceiro lugar no Campeonato da II Divisão de Honra, subindo à I Divisão.
1998
A Naval 1.º de Maio ficou em terceiro lugar no Campeonato da II Divisão B.
1999
12 de outubro – A UEFA atribuiu a Portugal a organização do Euro 2004.
A Associação Académica de Coimbra desce à II Divisão, ficando no último lugar da I Divisão.
2000
No denominado “Campeonato de Sempre” do futebol português no século XX, a Associação Académica de Coimbra ficou em 9.º lugar (com três presenças em provas internacionais: duas na Taça UEFA e uma na Taça das Taças) e o CF União de Coimbra em 61º lugar.